สำนักงานมาตรฐานเกษตรอินทรีย์ ภายใต้การดำเนินการของบริษัท เอซีทีออร์แกนิค จำกัด ได้รับการรับรองระบบงานเกษตรอินทรีย์ IFOAM, EU, CANADA, ACT และระบบงาน ISO17065 โดยหน่วยงานที่ทำการตรวจประเมินและรับรองระบบงานได้แก่ IOAS หรือ International Organic Accreditation Service เป็นองค์กรที่ไม่แสวงหาผลกำไรที่ทำงานในระดับสากล ให้การตรวจประเมินและรับรองความสามารถขององค์กรตรวจรับรองเกษตรอินทรีย์ ซึ่งจะให้การรับรองมาตรฐาน ให้ผู้ผลิตเกษตรอินทรีย์อีกทอดหนึ่ง ซึ่งจะทำให้ผู้บริโภคสามารถไว้วางใจผลิตภัณฑ์ที่มีตรารับรองเหล่านี้
IOAS (International Organic Accreditation Service) ก่อตั้งขึ้นโดย สหพันธ์เกษตรอินทรีย์นานาชาติ (IFOAM) ในปี 1997 โดยมีเป้าหมายในการพัฒนาโปรแกรมการรับรอง (IFOAM accreditation) เพื่อสร้างความเชื่อมั่นระหว่างหน่วยงานรับรองมาตรฐานเกษตรอินทรีย์และส่งเสริมการผลิตอินทรีย์และการตลาด ส่งผลให้เกิดตลาดสินค้าเกษตรอินทรีย์ระหว่างประเทศขึ้นและเติบโตอย่างมีนัยสำคัญในปัจจุบัน
IOAS ทำงานในบทบาทขององค์กรกลางที่ให้บริการตรวจสอบและรับรองให้กับหน่วยงานตรวจรับรองหรือควบคุม ที่เรียกว่า Certification Body หรือ Control Body โดยตรวจสอบการใช้มาตรฐานที่ถูกต้องและข้อกำหนดสำหรับการรับรอง วัตถุประสงค์ ความเป็นกลางและโปร่งใส เป็นอิสระจากความขัดแย้งทางผลประโยชน์ มกท.จะได้รับการตรวจสอบระบบงานอย่างน้อยปีละ 1 ครั้งโดยมีทั้งการตรวจระบบเอกสารการทำงานและการสังเกตการณ์ทำงานขณะให้บริการตรวจสถานที่ผลิต
